1)吴晓磊,曾景海,屈睿,晏芸,硫酸盐还原原核生物检测的组合基因探针及其检测方法,国家发明专利,专利号为200410086710.7;
2)晏芸,屈睿,吴晓磊,FISH 杂交计数板及其计数方法, 申请国家发明专利,专利号为200510002789.5;
3)吴晓磊,郭斌,余素林,内置微孔滤膜的连通式微生物培养装置及其培养方法申请号:200710099489.2
4)鲁安怀、李艳、金松、吴晓磊、郝瑞霞、王长秋、曾翠平、王鑫、丁hong瑞、吕明,光燃料电池,200810114700;
5)吴晓磊、孙纪全、汤岳琴、刘伟强、赵晶晶、郭鹏,一株棒杆菌菌株及其应用,专利申请号:2010101084491;
6)吴晓磊、孙纪全、汤岳琴、陈福明、刘伟强、赵晶晶、郭鹏,一株假单胞菌菌株及其应用,专利申请号:2010101084561;
7)吴晓磊、孙纪全、汤岳琴、刘伟强、赵晶晶、郭鹏,一株Diaphorobacter 菌株及其应用,专利申请号:2010101084468;
8)吴晓磊、汤岳琴、池昌桥、郭鹏,配制荧光原位杂交的杂交液和洗涤液的方法,专利申请号:2010101128818;
9)吴晓磊、汤岳琴、池昌桥、郭鹏,一种DNA 提取试剂盒及其应用,专利申请号:2010101128733;
10) 吴晓磊、汤岳琴、郭鹏、池昌桥,联合吞吐和驱替的微生物采油方法,专利申请号:201010146465X;
11) 吴晓磊、汤岳琴、郭鹏、池昌桥,一种微生物采油方法,201010146472X。